识别与免疫浸润相关的脱落凋亡生物标志物以诊断急性心肌梗死Identification of anoikis-related biomarkers linking immune infiltration to acute myocardial infarction - Brazilian Journal of Medical and Biological Research

环球医讯 / 心脑血管来源:www.bjournal.org巴西 - 英语2025-11-19 01:12:02 - 阅读时长2分钟 - 911字
本研究通过整合生物信息学分析与实验验证,系统探究了脱落凋亡相关基因在急性心肌梗死(AMI)中的表达特征及其与免疫浸润的关联。研究团队从GEO数据库获取AMI患者数据,筛选出21个在AMI样本中显著上调表达的脱落凋亡相关差异基因,并通过功能富集分析发现这些基因主要参与肽酶活性调控和细胞外基质重构。免疫细胞浸润分析揭示了AMI患者与健康人群间14种免疫细胞的显著差异分布。研究进一步运用多种机器学习算法筛选出9个关键风险基因(ITPRIP、MMP9等),并成功构建了高精度诊断列线图(AUC=0.962),为AMI的早期诊断和个体化免疫治疗提供了重要的生物标志物基础和理论依据。
急性心肌梗死脱落凋亡生物标志物免疫浸润列线图
识别与免疫浸润相关的脱落凋亡生物标志物以诊断急性心肌梗死

识别与免疫浸润相关的脱落凋亡生物标志物以诊断急性心肌梗死

本研究旨在识别用于急性心肌梗死(AMI)早期诊断的新生物标志物。研究者从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库下载了GSE66360和GSE48060数据集。使用"limma"工具筛选差异表达基因(DEGs)。从GeneCard数据库获取了557个与脱落凋亡(anoikis)相关的基因(ARGs)。通过将DEGs与ARGs交叉分析得到差异表达的ARGs(DEARGs)。使用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)、支持向量机(SVM)和随机森林(RF)筛选核心DEARGs。使用实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)确定核心DEARGs的表达。共获得21个DEARGs,它们在AMI样本中均上调表达。功能富集分析显示,DEARGs主要富集在肽酶活性和细胞外基质相关功能。免疫细胞浸润分析揭示了AMI组与正常组之间14种免疫细胞存在显著差异。通过LASSO、SVM和RF筛选出9个特征风险基因,包括ITPRIPMMP9NAMPTCDKN1APLAURPLAUSERPINA1THBS1FN1。RT-qPCR分析验证了这些特征基因在AMI患者中上调表达,与主要生物信息学分析结果基本一致。研究者还在GSE48060数据集中验证了9个核心DEARGs,并通过整合这些DEARGs构建了列线图(nomogram)。本研究分析了AMI和正常样本中ARGs的差异表达和免疫谱型,筛选出9个预测AMI的风险特征基因,为AMI的免疫治疗方案提供了理论基础。

关键词: 急性心肌梗死;脱落凋亡;生物标志物;免疫浸润;列线图

图8 列线图的建立与验证。A,通过RT-qPCR评估急性心肌梗死(AMI)患者和健康对照者的血液样本中的基因表达。数据以均值和标准差表示。*P<0.05(t检验)。B,AMI诊断的列线图。C,列线图的校准曲线。D,列线图的决策曲线分析。E,ROC曲线:AUC为0.962。F,评估列线图和单个基因预后准确性的ROC曲线。ROC:受试者工作特征曲线。AUC:ROC曲线下面积。

【全文结束】

大健康

猜你喜欢

  • 复活古代DNA技术研究历史疾病演变复活古代DNA技术研究历史疾病演变
  • 口腔微生物与胰腺癌风险关联:有害菌群使患病风险激增三倍口腔微生物与胰腺癌风险关联:有害菌群使患病风险激增三倍
  • 阿尔茨海默病研发的下一个飞跃即将到来但并非近在咫尺阿尔茨海默病研发的下一个飞跃即将到来但并非近在咫尺
  • 高纤维饮食或能恢复抗癌免疫细胞活力研究发现高纤维饮食或能恢复抗癌免疫细胞活力研究发现
  • 心肌肌球蛋白结合蛋白C对急性心肌梗死早期诊断的增量价值心肌肌球蛋白结合蛋白C对急性心肌梗死早期诊断的增量价值
  • 这种极为常见的不良睡眠习惯会增加你患心脏病的风险这种极为常见的不良睡眠习惯会增加你患心脏病的风险
  • 口腔微生物与胰腺癌风险增加三倍相关口腔微生物与胰腺癌风险增加三倍相关
  • 卫生官员聚焦食物过敏率急剧上升现象卫生官员聚焦食物过敏率急剧上升现象
  • 英国NHS改革:前列腺癌患者将获视频问诊与居家血液检测服务英国NHS改革:前列腺癌患者将获视频问诊与居家血液检测服务
  • 如何调节生物钟以获得最佳健康如何调节生物钟以获得最佳健康
大健康
大健康

热点资讯

大健康

全站热点

大健康

全站热文

大健康