概述
主要研究领域
Microbiome期刊主要探讨微生物组、微生物生态学、宏基因组学、微生物学和生态学等领域。该期刊将微生物组研究与医学微生物学、肠道菌群、粪便样本和进化生物学等其他学科主题相融合。免疫学是该期刊医学微生物学研究的核心基础。
该期刊中关于肠道菌群的问题与内科学和生理学研究有所重叠。其内科学研究可关联到胃肠病学和内分泌学等其他研究领域。在微生物生态学方面的研究对动物学、宿主生物学、生态系统和微生物种群生物学研究具有重要参考价值。
除了宏基因组学研究外，该期刊还深入探讨耐药组、基因组、计算生物学和DNA测序等课题。其微生物学研究与乳酸杆菌等相关概念有所交叉。该期刊的研究内容超越了传统生态学范畴，还涵盖全生物体(Holobiont)研究。
主要研究领域占比：
- 微生物组(45.52%)
- 微生物生态学(42.82%)
- 宏基因组学(26.11%)
高被引论文
该期刊上被引用次数最多的论文包括：
- 《利用QIIME 2的q2-feature-classifier插件优化标记基因扩增子序列的分类》(964次引用)
- 《在Illumina MiSeq平台上用于多重16S rRNA基因测序的改进双索引方法》(918次引用)
- 《归一化和微生物差异丰度策略取决于数据特征》(792次引用)
高被引论文研究领域
该期刊论文主要关注微生物组、微生物生态学、微生物学、宏基因组学和肠道菌群等领域。论文讨论不仅聚焦微生物组，还提供了免疫学和厚壁菌门等相关领域的洞见。发表的文章在微生物生态学研究中拓展了全生物体、根际和植物学等交叉概念的讨论。
论文引用随时间变化
期刊有效性的一个关键指标是其发表的论文在研究人员中的影响力。
下图展示了论文发表后随时间推移的引用次数四分位范围(第一四分位数25%、中位数50%和第三四分位数75%)。
顶级作者及变化趋势
在Microbiome期刊上发表论文最多的顶级作者(基于发表论文数量)包括：
- 罗伯·奈特(Rob Knight)(25篇论文)，在最新一期发表5篇论文，比前一期多2篇
- 雅克·拉维尔(Jacques Ravel)(20篇论文)，在最新一期发表1篇论文，与前一期数量相同
- 杰克·吉尔伯特(Jack A. Gilbert)(15篇论文)，在最新一期发表2篇论文，与前一期数量相同
- 张彤(Tong Zhang)(14篇论文)，在最新一期发表2篇论文，比前一期多1篇
- 马丁·J·布莱泽(Martin J. Blaser)(11篇论文)，在最新一期发表1篇论文
顶级作者在该期刊的发表趋势如下图所示，展示了各期刊版本中顶级作者的论文数量变化。
顶级机构及变化趋势
仅考虑有明确所属机构的论文
在Microbiome期刊上发表论文最多的顶级机构(基于发表论文数量)包括：
- 中国科学院(57篇论文)，在最新一期发表18篇论文，比前一期多8篇
- 加州大学圣地亚哥分校(36篇论文)，在最新一期发表7篇论文，与前一期数量相同
- 密歇根大学(33篇论文)，在最新一期发表5篇论文，比前一期多3篇
- 马里兰大学巴尔的摩分校(33篇论文)，在最新一期发表1篇论文，比前一期少3篇
- 哈佛大学(30篇论文)，在最新一期发表5篇论文，比前一期多2篇
顶级机构在该期刊的发表趋势如下图所示，展示了各期刊版本中顶级机构的论文数量变化。
基于机构的发表机会
发表机会指数显示了最佳研究机构在期刊版本中发表的文章数与该期刊所有发表文章数的比率。最佳研究机构是根据所有期刊版本中发表论文总数最多的机构选出的。
下图展示了基于机构排名层级(前1-10名、前11-20名、前21-50名和50名+)的文章百分比比率。仅考虑有明确所属机构的文章。
在最近的2021年版本中，**0.48%**的出版物没有明确的机构归属。在有明确机构归属的出版物中，**23.79%至少有一位作者来自该期刊前10名的机构。另有9.71%包括来自前11-20名研究机构的作者。21-50名范围的机构贡献了21.84%的所有出版物，而44.66%**来自其他机构。
回归作者指数
研究人员发表科学文章时的一个常见现象是有意选择他们过去曾参与过的期刊。特别值得分析的是作者年复一年参与同一期刊的情况。
下面的回归作者指数展示了参与给定期刊及其前一期的作者比例与给定年份所有参与者的比例关系。
回归机构指数
下图显示了回归机构指数，说明了参与给定期刊及其前一期的机构比例与给定年份所有参与机构的比例关系。
经验与创新指数
我们的经验与创新指数旨在展示在期刊上发表文章的作者经验水平的横截面。该指数包括在期刊最新一期发表文章的作者，按其整个学术生涯中发表的出版物总数(P)和这些出版物获得的总引用次数(C)分组。
分组间隔经过实证选择，以最好地展示作者经验的多样性，标签选择仅为方便起见，并非评判。作者被分为以下几组：
- 新手(Novice) - P < 5或C < 25(发表论文数少于5篇或引用次数少于25次)
- 熟练者(Competent) - P < 10或C < 100(发表论文数少于10篇或引用次数少于100次)
- 有经验者(Experienced) - P < 25或C < 625(发表论文数少于25篇或引用次数少于625次)
- 专家(Master) - P < 50或C < 2500(发表论文数少于50篇或引用次数少于2500次)
- 明星(Star) - P ≥ 50且C ≥ 2500(发表论文数大于50篇且引用次数大于2500次)
下图说明了多作者出版物中第一作者的经验水平。
顶级出版物
- 人类肠道真菌组的肠型 (2022年) - 2252次引用
- 微生物组定义再审视：旧概念与新挑战 (2020年) 作者：Gabriele Berg; Daria Rybakova; Doreen Fischer; Tomislav Cernava - 2027次引用
- VirSorter2：一种多分类器、专家指导的检测多样化DNA和RNA病毒的方法 (2021年) 作者：Jiarong Guo; Ben Bolduc; Ahmed A. Zayed; Arvind Varsani; Arvind Varsani - 1221次引用
- VALENCIA：基于组成的阴道微生物群落最近质心分类方法 (2020年) 作者：Bing Ma; Pawel Gajer; Sarah Brown - 399次引用
- 微小而强大：Patescibacteria超门对地下水环境的适应驱动其基因组简化 (2020年) 作者：Renmao Tian; Daliang Ning; Zhili He; Ping Zhang - 375次引用
- 粪便微生物群移植维持克罗恩病缓解：一项试点随机对照研究 (2020年) 作者：Harry Sokol; Cecilia Landman; Philippe Seksik; Laurence Berard - 334次引用
- 囊性纤维化中的肺功能与微生物群多样性 (2020年) 作者：Leah Cuthbertson; Alan W. Walker; Alan W. Walker; Anna E. Oliver; Geraint B. Rogers - 254次引用
- 常用膳食乳化剂对人类肠道微生物群的直接影响 (2021年) 作者：Sabrine Naimi; Emilie Viennois; Andrew T. Gewirtz; Benoit Chassaing - 249次引用
- 人工环境中的病毒(VIBE)会议报告 (2020年) 作者：Aaron J. Prussin; Jessica A. Belser; Werner Bischoff; Scott T. Kelley - 219次引用
- 微生态科赫假设揭示肠道微生物群失调导致虾白粪综合征 (2020年) 作者：Zhijian Huang; Shenzheng Zeng; Jinbo Xiong; Dongwei Hou - 203次引用
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